Ancestría Online
Resultados de ChileGenomico en la Web
Sitio web de divulgación de los resultados del estudio ChileGenomico. Aquí podrás explorar los perfiles genéticos asociados a ascendencia (también llamada ancestría) amerindia, africana y europea de los Chilenos. Podrás explorar si existe o no asociación con riesgo genético de sufrir una enfermedad o con otras características poblacionales que tu mismo puedes subir a la plataforma.
Gráfico de asociación entre dos variables
Selecciona las variables que deseas estudiar en el panel izquierdo y el gráfico se modificará automáticamente. Puedes obtener más información poniendo el mouse sobre un punto específico del grafico.
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Estudio ChileGenomico
Este sito hace disponibles los resultados del proyecto ChileGenomico por comuna de Chile. El proyecto estudia el ADN de voluntarios mediante ensayos de laboratorio que permiten estimar su ascendencia y su riesgo de sufrir enfermedades. La razón de estudiar ambos radica en que el uso de información genética es cada vez más frecuente en medicina y nutrición. Sin embargo, los chilenos somos heterogéneos en cuanto a nuestra composición genética producto del origen diverso de nuestros ancestros y de la estratificación social de la población. Por lo tanto, las asociaciones entre genética y enfermedad pueden no ser adecuadas si no se considera la ascendencia particular de cada persona.
Ascendencia
En el contexto de la genética de poblaciones, llamamos ascendencia, o ancestría, a la proporción de los ancestros de una persona que provienen de un origen particular. La mayoría de los chilenos son descendientes de un mezcla ocurrida varias generaciones atrás entre migrantes europeos, principalmente españoles, migrates africanos y la población indígena que habitaba el territorio que actualmente constituye Chile. Mediante el estudio comparativo de la secuencia de ADN de una persona y la de poblaciones similares a aquellas que participaron del proceso de mestizaje, es posible estimar la proporción de ancestros de un chileno que provienen de cada origen ancestral.
Nuestra base de datos contiene estimaciones de ascendencia para seis orígenes ancestrales: africana (AFR), europea (EUR), sudeste asiático (EAS), amerindia (AMR), aimará (AYM) y mapuche (MAP). La ancestría AMR corresponde a aquella que proviene de cualquier pueblo indígena de américa. Para la mayoría de los chilenos, corresponde a ancestros aimará o mapuche. En el presente estudio, agrupamos en la ancestría MAP a los ancestros provenientes de cualquier pueblo indígena cercano genética mente al pueblo mapuche actual. Esto incluye a los pehuenche, huilliche y otros que ya no existen como pueblo en la actualidad pero que sus genes pueden estar presentes en el genoma de los chilenos, como los picunche.
Riesgo genético
Los investigadores del proyecto realizaron una búsqueda sistemática de los marcadores moleculares de riesgo genético que han sido reportados en la literatura para nueve enfermedades prevalentes en Chile. Los marcadores moleculares son sitios del ADN que pueden tener más de una versión entre los individuos, es decir, son polimórficos. La gran mayoría de estos marcadores del tipo SNP (por su sigla en inglés Single Nucleotide Polymorphism. Por ejemplo, un individuo puede tener un genotipo A/C, mientras que otros, pueden tener A/A o C/C. En cada caso, un alelo fue herdado de la madre y el otro del padre. Mediante estudios genético-epidemiológicos, es posible determinar si personas que portan un alelo determinado, están en mayor o menor riesgo de sufrir una enfermedad que aquellos que no lo portan. Si bien la mayoría de los estudios de asociación genética no han sido realizados en Chile, se seleccionaron aquellos estudios realizados en poblaciones latinas o europeas por su relación con los ancestros de los Chilenos. También se consideraron estudios en poblaciones asiáticas dado que las poblaciones amerindias tienen un origen en ese continente.Se priorizaron aquellos marcadores con la mayor fuerza de asociación con a lo menos una de las nueve enfermedades consideradas. Nuestra búsqueda resultó en una base de datos que contiene 159 SNPs de riesgo:
| Enfermedad | No. de SNPs |
|---|---|
| Cáncer colorrectal | 20 |
| Enfermedad coronaria | 18 |
| Diabetes mellitus 2 | 21 |
| Enfermedad de Parkinson | 23 |
| Cáncer gástrico | 21 |
| Cáncer de mama | 19 |
| Colelitiasis | 4 |
| Hígado graso | 10 |
| Falla renal | 23 |
Gráficos
Defina el título del gráfico en "Graph title" y elija las variables a evaluar.
Tablas de datos a nivel de comuna
Nuestra base de datos por comuna de Chile contiene la siguientes variables:
| Variable | Descripción |
| County | Nombre de la comuna de origen |
| N | Cantidad de individuos en la comuna |
| Region | Número administrativo de la región |
| Resid.Region | Nombre de la región de residencia |
| AFR | Proporción del genoma con ancestría africana |
| EUR | Proporción del genoma con ancestría europea |
| EAS | Proporción del genoma con ancestría del sudeste asiático |
| AMR | Proporción del genoma con ancestría amerindia |
| AYM | Proporción del genoma con ancestría aimará |
| MAP | Proporción del genoma con ancestría mapuche |
| Class | Promedio de estrato social (1=ABC1, 2=C2, 3=C3, 4=D, 5=E) |
| Riesgo.Colelitiasis | Riesgo genético de Colelitiasis |
| Riesgo.CColorectal | Riesgo genético de Cáncer Colorectal |
| Riesgo.CGastrico | Riesgo genético de Cáncer Gastrico |
| Riesgo.CMama | Riesgo genético de Cáncer de Mama |
| Riesgo.DM2 | Riesgo genético de Diabetes Mellitus tipo 2 |
| Riesgo.ECoronaria | Riesgo genético de Enfermedad Coronaria |
| Riesgo.EParkinson | Riesgo genético de Enfermedad de Parkinson |
| Riesgo.FallaRenal | Riesgo genético de Falla Rena Diabétical |
| Riesgo.HigadoGraso | Riesgo genético de Hígado Graso no Alcohólico |